Margarita Bego diplomirala je 1990. godine na Fakultetu šumarstva i drvne tehnologije Sveučilišta u Zagrebu, gdje je 2015. godine i doktorirala. Njezino stručno i znanstveno-istraživačko rad usmjeren je na istraživanje svojstava drva i drvenih konstrukcija, korištenje drva u konzervaciji i restauraciji te mogućnosti njegove ponovne upotrebe.
Dobila je diplomu Bavarske obrtničke komore za rad s drvom i prijenos stručnog znanja kao multiplikatorica te je bila jedina žena iz Hrvatske koja je završila taj program. U svojoj profesionalnoj karijeri sudjelovala je na brojnim stručnim i znanstvenim seminarima i konferencijama te objavljuje znanstvene članke iz područja istraživanja drva i njegove upotrebe.
Zaposlena je na Sveučilištu u Dubrovniku, gdje je za svoj rad sa studentima dvaput dobila nagradu Sveučilišta u Dubrovniku. Trenutno vodi istraživački projekt BIOTRAG – Priče iz vode i vatre, u okviru kojeg zajedno s suradnicima istražuje svojstva drva izloženog požaru, te naplavnog drva iz mora i rijeka s ciljem njegove ponovne upotrebe.
Sudjeluje i u europskim projektima usmjerenim na održivu upotrebu prirodnih resursa, kružno gospodarstvo te istraživanje i razvoj novih biokompozitnih materijala.
